中国农业科学院烟草研究所成立于1958年，是经国务院科学规划委员会批准、农业部设立的国家农业专业研究机构。1959年，经山东省人民委员会批准增名“山东省烟草研究所”。1987年，经国家科委、劳动人事部批准增名“中国烟草总公司青州烟草研究所”，实行以中国农业科学院为主的领导体制，是我国唯一的国家级烟草农业科研事业单位。研究所先后荣获中国农业科学院文明单位、山东省文明单位和农业部绩效考核优秀单位，所党委连续被评为中国农科院先进基层党组织和青岛市先进基层党组织。

研究所设有4个职能部门、8个研究中心和1个支撑服务部门，建有国家烟草改良中心、农业农村部烟草生物学与加工重点实验室、烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室等24个国家和省部级科技创新平台，以及中美植物衰老联合实验室等5个国际合作平台。构建起以青岛所部为中心，青州所区、青岛试验基地、西南试验基地、宣城试验基地为支撑的“一所五地”发展布局。2018年，中国农业科学院青岛特种作物研究中心依托我所正式组建。

现有在职职工215人。其中，专业技术人员206人，45岁以下专业技术人员占比69%。正高级职称34人，副高级职称75人；具有博士学位119人，硕士学位62人。享受国务院政府特殊津贴10人，农业部和山东省中青年突贡专家3人，中国农科院“农科英才”5人，山东省泰山学者青年专家3人，柔性引进高层次人才4人，6人被遴选为中国农业科学院创新团队首席科学家。2013年，研究所启动实施中国农业科学院科技创新工程，组建成立了烟草种质资源与生物育种、烟草智慧农业、烟草病虫害绿色防控、烟草功能基因组、烟草功能成分与生物合成、滨海盐碱地生物资源评价利用等7支科技创新团队。

设有作物遗传育种学、作物栽培与耕作学、植物保护和食品科学与工程等4个一级学科博士学位授权点和8个二级学科硕士学位授权点，现有博士生导师12人，硕士生导师67人，培养出博士硕士研究生424人，年度在读研究生150余人。设有博士后流动站和博士后工作站，常年在站博士后20余人。与西昌市人民政府、中国农业科学院研究生院共建了“中国农业科学院博士创新基地（西昌）”、“中国农业科学院研究生培养实践基地（西昌）”等人才培养平台，与青岛农业大学联合培养烟草专业本科生。

拥有科研、实验用房（楼）等总建筑面积约41000 m²，专用科研仪器设备1890余台（套），馆藏图书、资料、期刊共60000余册（部）。

经过60多年的建设与发展，研究所已成为学科齐全、专业人才集中、技术储备雄厚、优势突出、科技创新和成果转化水平较高的国家级烟草农业综合性研究机构。承担烟草遗传育种、栽培营养、植物保护、调制加工、生物技术、质量安全、植物功能成分、海洋农业等学科领域科研任务，在烟草功能基因组、病虫害绿色防控、低危害烟叶开发、“高香低害”品种选育、烟草功能成分综合利用等方面开展协同攻关，实现了国际首次烟草单倍体育种和体细胞杂交重大突破。保存烟草种质资源6154份，独家保存量居世界首位。参与构建了烟草全基因组图谱，创制了全球最大规模的烟草突变体材料库（27万份），构建了烟草全基因组模块化育种技术体系，初步建成了全国烟草病虫害绿色防控体系，建立了重金属消减技术体系、降焦关键技术体系和农药残留控制技术体系，开发了烟草主要功能成分提取及综合利用技术，拓展了烟草的新功能、新用途、新产品。1978年以来，先后获得国家级科技成果奖励13项，省部级奖138项，育成54个国审烟草新品种，制修订国家和行业标准112项，获授权国家发明专利414项、出版科技专著75部，发表学术论文4000余篇。

研究所始终坚持面向产区、服务三农，积极推动科技成果转化，参与策划5次全国烟叶生产现场会，共建了沪皖现代烟草农业高科技示范园、宣州现代功能农业科创园、四川凉山院企联创技术中心等科技研发平台，探索形成了湖北恩施“清江源山地生态烟开发”、山东诸城“精益生产”、安徽皖南“烟区现代农业”、四川凉山“原生态特色农业”等4种烟区现代农业发展模式。牵头构建了全国烟草品种区域试验网络、病虫害预测预报网络，在全国17个植烟省建立了85个核心科技示范园区，建立了覆盖全国烟区的服务“三农”支撑体系，常年有60余名专家深入烟叶生产一线开展技术服务和推广工作；与20多家省级烟草工商企业开展全面合作，在特色优质烟叶开发、原料保障体系建设、雪茄烟生产技术与品种培育、特征香韵突变体评价、新型烟草制品开发等领域开展了卓有成效的工作，转化应用海藻生物有机肥、灵菌红素植物病毒病免疫诱抗剂等一批科技成果，为烟草行业创新发展和烟农持续增收提供了有力的科技支撑。中央电视台、《人民日报》、《科技日报》、《农民日报》等多家新闻媒体对烟草所“面向产区，服务三农”方面取得的成绩进行了全方位的宣传报道。

展望未来，烟草所将按照习近平总书记 “四个面向”“两个一流”重要指示要求，立足新发展阶段，贯彻新发展理念，构建新发展格局，以科技创新工程为引领，以提升自主创新能力和科技成果孵化转化能力为核心，着力打造国家战略科技力量，为实施乡村振兴、推进农业农村现代化和烟草行业高质量发展提供有力科技支撑。