2014年以来，团队承担了国家自然科学基金面上项目4项，青年科学基金项目9项，烟草基因组重大专项项目11项，重点实验室、重大专项及重点项目子项目等5项，累计科研经费5469万元；发表SCI论文84篇，核心期刊论文74篇；授权国家发明专利18件，获得软件著作权14项；出版中、英文专著各1部；1个烟草品种通过全国烟草品种审定；共同完成的“烟草全基因组图谱构建”获中国烟草总公司科技进步特等奖。

　　1.植物发育生物学方向

　　以烟草功能基因组为出发点，以前期获得的突变体等材料及关键调控基因为支撑，从腋芽发育、植物衰老和细胞壁多糖代谢三个重点方向开展研究工作。（1）烟草腋芽发育：对烟草腋芽发育关键基因功能进行系统研究，构建适应于烟草腋芽的可诱导表达体系，成功获得了烟草腋芽生长抑制材料，为开发成熟的烟草腋芽分子调控技术并最终解决生产上“打顶、抹杈”问题奠定基础；（2）植物叶片衰老：克隆并解析了多个衰老相关基因功能，系统分析叶片衰老启动及进程在分子水平的调控机制；重点开展植物多肽信号调控叶片衰老的分子机制研究，对CLE14等多肽信号及可能的受体蛋白激酶在叶片衰老调控中的作用进行了系统分析；（3）细胞壁多糖合成与代谢：利用遗传分析、组织化学、免疫组化实验等手段证实拟南芥MYB52和ERF4转录因子能够通过调控果胶质的甲酯化程度影响种子粘液质结构，深入解析了植物细胞壁果胶质脱甲酯化过程的分子调控网络，为人工分子设计细胞壁的结构奠定了理论基础。相关成果已在“The Plant Cell”(2020)、“Plant Physiology”(2018)等杂志发表，出版英文专著《Plant Senescence-Methods and Protocols》（2018）。

　　2.植物代谢生物学方向

　　搭建了全球最大规模的烟草突变体材料保存库和“中国烟草突变资源生物信息库和利用平台”，共收录保存各类烟草突变体材料27万份, 为烟草代谢生物学研究提供了材料基础。采用多种组学方法，明确了参与烟草腺毛发育和分泌特性相关基因，阐明腺毛代谢物调控烟叶品质规律；解析了烟草糖酯和茄尼醇等物质的合成和贮存部位、代谢调控因子、合成途径和关键酶及其编码基因；图位克隆了普通烟草中的两个新的参与叶绿素代谢相关基因并阐明了其分子作用机制；完成了玫瑰香韵突变基因的定位克隆。开发了一系列与烟草香气和低害性状相关的分子标记，通过田间嗅闻、气相色谱质谱联用仪（GC-MS）鉴定、结合分子标记辅助育种方法，历经十年选育成了“中烟特香301”新品种、“特18”特征香韵新品系、“高蔗糖酯K326”和“低苯并芘K326”新品系。相关成果在“Molecular Breeding”(2014，2016)、“Planta” (2017，2020)等杂志发表，出版专著《烟草突变体》。

　　3.植物逆境生物学方向

　　利用SNP标记定位技术结合全基因组和转录组测序分析，定位克隆了西柏三烯二醇合成酶基因。烟草西柏三烯一醇转变为西柏三烯二醇的合成途径受阻导致西柏三烯一醇含量显著提高从而产生了蚜虫抗性。利用分子标记辅助育种技术，定向改良K326和红花大金元特色品种，培育的抗蚜虫K326定向改良新品系2020年通过田间鉴评。从EMS突变体库中筛选获得烟草抗青枯病突变体，结合自然病圃和室内接种对突变体青枯病抗性进行了系统鉴定并明确了抗性遗传规律，初步定位了青枯病抗性基因。以抗性突变体为抗源材料，对翠碧一号、云烟87等烟草栽培品种开展青枯病抗性的定向改良。利用分子标记定位技术，初步定位了南方根结线虫抗性基因，精细定位了黑胫病抗性QTL，对特色品种红花大金元进行了定向改良。相关成果在“Molecular Breeding”(2020)等杂志发表。

　　4.植物生物反应器方向

　　通过组学及分子生物学手段，解析本氏烟草中高效表达外源蛋白的分子机制，明确本氏烟草作为生物反应器载体的分子基础；优化基因策略提高外源蛋白高效表达模式，构建适用于多种蛋白表达-提取-纯化的生物反应器体系，实现本氏烟草作为生物反应器载体的高效利用。目前，本研究方向致力于通过与相关企业合作，利用瞬时表达技术生产胶原蛋白等医用蛋白，充分发挥技术优势，结合市场需求，加速推进研究成果的转化工作。